人是一個有機的整體。在體內以五臟(心、肝、脾、肺、腎)和六腑(大腸、小腸、胃、膽、膀胱、三焦)為核心，分別聯系著五官(耳、眼、口、鼻、舌)、五體(筋、骨、脈、肌、皮)，而且臟與臟、臟與腑之間又密切聯系砭石，形成陰陽相配，表里相合的關系。臟腑還與五行相配，如心與小腸相表里屬火，脾與胃相表里屬土，腎與膀胱相表里屬水，肝與膽相表里屬木，肺與大腸相表里屬金。
它們之間的聯系見下表：
肝與膽關系密切。這兩個臟腑從解剖部位看是相依聯系，從生理功能看是相互聯系，共同完成幫助消化，主疏泄的功能。從病理上看是互相影響。如肝開竅于目，所以肝膽病可以導致視物不清，或是目赤紅腫。肝主筋，所以還可以有爪甲枯萎的變化，常常還會脅下疼痛，肝膽病砭石實用療法請閱讀《砭術之肝病辯證論治》。
心與小腸關系密切。心有熱邪則會影響到小腸功能，小便會黃赤，舌尖會紅赤，甚至舌尖潰瘍，以及出現心神不安、煩躁等癥狀（更多砭石醫案請查看砭石養生欄目）。
脾與胃關系密切。中醫認為脾胃相互配合，是人后天之本。在人出生后，生存發育的關鍵是脾胃。脾胃主受納消化飲食，供給全身營養。凡飲食減少或偏食，必致身體衰弱，但過分的強食暴飲也會傷及脾胃，使身體不能吸收營養，造成肌肉痿軟、口唇不榮等。
肺與大腸關系密切，有肺病的人常大便干。而大便秘結日久不下，又會加重喘咳，造成皮膚毫毛枯燥而不潤澤。
腎與膀胱關系密切。腎主貯藏“精”氣，是人體先天之本，同時又控制二便的生成和排泄。貯存在膀胱的尿液要在腎氣的作用（請進入砭石養生中的砭石醫案欄目瀏覽更多內容）下才能排出體外，如果腎氣虛就會出現遺尿或尿后余瀝不盡等癥狀。另外，腎亦王生姐，開與性功能有關。
在五臟之中，“心”就如同宮廷中的君主，較為重要，在五行屬火。肺如宰相，調節輔佐君主，在五行屬金。肝如將軍，五行屬木。脾如后勤部長，五行屬土，是后天之本。腎主藏精氣，早先天之本，在五行屬水。五臟可謂缺一不可，互相制約又互相亨撐，稱為相生和相克。只有相生，而無相克，則會使一臟亢奮，影響到正常生理功能；只是相克，而相生不足，則會發生一臟衰弱，也會影響到正常生理功能。就如同生態平衡一樣，必須有一常量，才能使人保持健康。
五臟相生相克關系圖
在臟腑與五體(筋、脈、肉、皮、骨)和五官(目、耳、口、鼻、舌)之間，相表里臟腑之間，五臟之間都有相聯系的通道。人體中還有腦、髓、骨、脈、膽、女子胞稱為奇恒之腑，也與五臟之間有密切的聯系。這些聯系都是由體內復雜的網絡系統完成的。這個網絡系統，給各臟腑器官、組織運送必要的營養物質，即“氣”和“血”，并且調節各臟腑器官，組織之間的平衡，防御各種疾病（更多砭石醫案請查看砭石養生欄目），還負責管理人體的發育成長。這個網絡系統就是經絡系統。所以經絡（砭石使用結合穴位效果更佳，詳情請看砭石養生欄目）系統就是人體當中除臟腑系統之外的第二個重要的組成部分。經絡系統比照現代醫學，應該包括神經、血管、淋巴、內分泌、體液、細胞間隙還有肌肉和皮膚等組織。這是中醫特有的認識，也是針灸治療（更多砭石使用和砭石養生請查看砭石百科和砭石養生欄目）疾病的基礎。
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